Los asociados de Fondesec realizan una cuota de ahorro mensual a través de descuento de nómina, la cual no puede ser inferior a cincuenta mil pesos ($50.000) hasta un máximo de dos (2) SMMLV.  Esta cuota de ahorro se distribuye en un 40% como aportes sociales y un 60% como ahorros permanentes.

Fondesec reconoce intereses sobre el ahorro permanente a una tasa de interés m.v. del 0.66%, los cuales son capitalizables.